首先，对己方的进攻路线和德军的撤退路线进行缜密的侦察，所有的步兵必须利用烟雾和夜幕进行掩护。支援小组和后备小组进行充分配合，互相支持，可以有效地阻止德军的反攻。突击小组用冲锋枪、手榴弹、匕首、刺刀进行短兵相接；支援小组利用机枪和反坦克炮等重型武器作战，另外还必须配有带着炸药和十字镐的工兵，用他们打开房间的墙壁。不过，这样做的危险就是炸开墙壁的时候，后面的德国人有可能会通过这个洞扔手雷过来，但大部分情况下还是安全的。让苏军士兵特别高兴的是，德军逃跑时留下了不少反坦克手雷，它们的威力足够炸死整个屋子里的人。进攻小组的苏军士兵很快消灭了一个又一个房间中的德军士兵。有的人则在房顶上前进，消灭那些高处的敌人；有的进入地下室，消灭那些持有反坦克火箭筒的德军士兵。在这种攻坚战中，苏军工兵的火焰喷射器发挥了巨大的作用。
<img src="/uploads/allimg/200606/1-200606232Z9600.jpg" />柏林街头的苏军M1931型203毫米重型攻城榴弹炮，其巨大的威力足以对德军堡垒进行毁灭性打击。
平民的出现并没有对苏军的进攻造成什么影响。苏军通常都会将平民从地下室里赶出来，强行疏散他们。这正是德军第6集团军在进攻斯大林格勒的战役中采取的方法。因为根本无法分清楚平民和士兵，有的苏军士兵只是往地下室扔1颗手雷，然后就继续前进。
面对城市搜索战，有经验的部队当然没有问题，可是那些只经过短期培训的年轻军官对此却毫无办法，他们不知道如何在不熟悉的环境下指挥作战。经过奥得河战役，再加上24小时急行军，很多苏军士兵已经疲惫不堪。体力的消耗让他们的反应速度减慢，甚至接错了迫击炮弹的引信，导致炮弹在炮管里爆炸，那些使用德军手雷的士兵还经常会误伤自己和身边的战友。
除此之外，各大集团军之间的误伤也频繁发生。当苏军各支队都向柏林中心集结时，一个集团军的炮兵和“喀秋莎”火箭炮经常会轰炸另外一个集团军。因为在市区内到处都是浓烟，朱可夫和科涅夫指挥的3个航空集团军常常会轰炸其他的集团军。特别是在柏林的南部，支援乌克兰第1方面军的航空团会攻击第8近卫坦克集团军。为此，崔可夫向朱可夫建议，请求友军部队撤出战场。
控制局面
4月26日，第1近卫坦克集团军和第8近卫集团军用去了大半天的时间，终于攻占了腾珀尔霍夫机场。德军的“慕赫堡”装甲师组织了快速反击，但由于坦克太少，他们只能依靠希特勒青年团和拥有反坦克火箭筒的步兵进行作战。党卫军大队长扎尔巴赫将党卫军第11装甲掷弹兵师的侦察营撤到了安哈尔特车站，而其他的装甲车辆和8辆“虎”式重型坦克向蒂尔花园区撤退。第2天早上，大规模的炮火轰炸开始，蒂尔花园区遭到了重创。一片狼藉的景象很难让人想象，这里曾经是孩子们最喜欢的游乐园。
崔可夫和卡图科夫命令部队向安哈尔特车站前进。朱可夫与科涅夫的竞争已经到了白热化阶段。崔可夫的军长格罗斯曼调侃道：“现在，我们面前最大的障碍不是德军，而是我们的友军。我已命令用废弃的坦克来阻挡友军到达帝国国会大厦。现在没有比听到友军的胜利更让我们感到沮丧的了。”崔可夫为此付出了惨重的代价，他让自己的左翼部队开到了第3近卫坦克集团军的前面，将后者调离帝国国会大厦。可是他也没有向雷巴尔科通告此事，很多士兵因此成了第1方面军炮火下的冤魂。
4月26日凌晨，柏林城防司令魏德林被大量的火箭弹爆炸声惊醒。他清楚地知道这是苏军的“喀秋莎”火箭炮在射击。很显然，他的指挥部已经在射程范围之内了，现在要做的就是马上转移指挥部。他希望将指挥部转移到柏林的本德勒区，德国陆军指挥部以前就设在这里，而且防空设施非常完备。在本德勒区的地下深处，魏德林的参谋们完全不知道此时外面究竟是白天还是黑夜，他们只能靠喝咖啡和吸烟提神。好在这里有发电机，照明还是很充足的，只是空气非常潮湿，让人不舒服。各战区都在向他们这里发来请求支援的电报，但是他们已经没有任何可以派往前线的增援部队了。
当天晚上，魏德林向希特勒汇报了撤退计划：首先，希特勒的警卫队向西突围，与维斯瓦河集团军残部会合。先头部队由40辆坦克组成，元首警卫队跟在后面，断后的是1个加强师，突围行动于4月28日晚开始实行。魏德林的计划非常周密，但希特勒摇了摇头说：“你的计划非常完美，但是我不想在森林里打游击，我要留在柏林，与帝国共存亡。你还是继续防御任务吧。”显然，魏德林进行的努力全部成为了泡影，“柏林与德国同在”的标语恰恰说明了现在的一切，现在的德国大概也就只剩下柏林了。
苏军一进驻柏林就建立了临时政府。现在，一些重要的机构已经开始重新运作了。朱可夫任命别尔扎林担任柏林指挥官，这位第5突击集团军的司令很有一手。但是朱可夫并不知道贝利亚早已经让“锄奸团”负责管理柏林的平民事务。从18世纪开始，红军有个传统，攻入城市的第1支部队，其指挥官将担任这个城市的“市长”。崔可夫对此极为不满，但是他没有任何办法。
格罗斯曼这样描述别尔扎林：“身材肥胖，褐色的眼睛，头发花白，机智镇定。”当天，他召见了所有的柏林要员，有市长，水电、下水道、地铁、天然气、环城高速铁路各个部门的负责人和各个工厂厂长。所有这些人都接受了新的职务，地区企业负责人成了国家的要员，副主管变成了主管。别尔扎林让市长组织一队人清扫破败的街区，而市长的话让他感到震惊，因为他建议给这些人报酬。德军曾经像对待奴隶一样对待苏联的劳工，德军曾经给过什么报酬吗？这个要求完全就是多余的！
4月27日，也就是第2天，苏军集合了2000名德国妇女，把她们赶到了腾珀尔霍夫机场，让她们清理跑道上遗留的残骸，因为苏军航空兵希望在24小时内使用该机场，作为空军基地。
德军向柏林市中心撤退的时候，双方又展开了遭遇战。德国人用反坦克火箭筒消灭一辆苏军坦克，苏军就会利用“喀秋莎”火箭炮进行报复。后来苏军俘虏了一小队党卫军的法国志愿掷弹兵。法国志愿兵称自己是德国人抓来的劳工，最后又强征入伍。苏军相信了他们的话，那时苏军还不认识党卫军的纹身标志。4月28日，克莱勃斯将军开始效仿他们的元首，欺骗下属部队。他仍然鼓吹美国人会在短时间内来到柏林，那时的局势便会好转。
<img src="/uploads/allimg/200606/1-200606232Z91P.jpg" />苏军炮兵正在为“喀秋莎”火箭炮装填火箭弹
当克鲁肯伯格听说党卫军第503重型坦克营的8辆“虎王”式重型坦克将归党卫军第11装甲掷弹兵师指挥时，顿时信心大增，其他增援力量还有拉脱维亚的一小队志愿者。
克鲁肯伯格的指挥所设在施塔特米托地铁站的一节车厢里。这里既没有电灯也没有电话，他们抢劫了柏林广场的一家杂货店才有了补给品。他们从临时军火库找到了大量的反坦克手雷，现在还能同苏军对抗，但是他们缺少重型武器。在使用反坦克手雷时，不仅能发挥它本来的反坦克效用，还可以与苏军步兵展开近战。在柏林的防御区内，阿德隆旅馆地下室的救护站接待了很多的德军伤员。而党卫军伤员被送到了帝国总理府地下室的一处救护站，那里有近500名伤员。
<img src="/uploads/allimg/200606/1-200606232910164.jpg" />1945年5月，柏林街头的苏军JS-2“斯大林”式重型坦克残骸，由于弹药殉爆，导致炮塔被炸飞。苏军在柏林攻坚战中也付出了巨大的代价。
反观苏军，各支部队攻入柏林的推进速度大不相同。西北部，科涅夫的第4近卫坦克集团军和第47集团军成功会师后向施潘达推进。在这个巨大的城堡内还有着不为人知的秘密，这里是德军进行“塔崩”和“沙林”神经毒气研究的地方。在柏林加图机场，苏军与德军进行了激烈的交战。空军军官学员和德军人民冲锋队队员藏在飞机残骸后面，使用88毫米高射炮向苏军射击。在北部，第3突击集团军到达了蒂尔花园区普伦茨劳贝格的北部，而第2近卫坦克集团军才冲过西门子斯特德。第3突击集团军聪明地绕过了火力凶猛的德军洪堡高射炮台，把它留给后方的重型火炮和轰炸机。第5突击集团军也同样绕过了腓特烈海恩掩体，主力已突进到法兰克福施普雷河南岸。在南部，第1近卫坦克集团军和第8近卫集团军到达了兰德韦尔运河，这里离帝国总理府不到2千米。在西南部，第3近卫坦克集团军突入夏洛滕堡，与德军第18装甲掷弹兵师残部进行交战。
为了“曼哈顿”计划
4月24日，苏军到达了达莱姆，紧接着进入了威廉物理研究所。雷巴尔科本人同他的集团军指挥官们，都不知道这座研究所的重要性。不过最近几天，秘密警察部队派出了大量专家，并且封锁了博尔茨曼大街。苏联“曼哈顿”计划唯一缺的就是铀，因此斯大林和贝利亚都非常重视德国研究所实验室中的设备和原料。为此，贝利亚还为柏林战役做了准备，希望能活捉进行铀研究的德国科学家们。马赫涅夫上将负责相关事宜，直接指挥苏联秘密警美国“曼哈顿”计划中用于放置试验原子弹的铁塔察部队。他是红军整个后方作战总指挥，地位绝不亚于赫鲁晓夫。苏联首席冶金学家扎韦尼亚金已在柏林城边建立了基地，苏联科学家负责实验室的拆装和运输工作。
<img src="/uploads/allimg/200606/1-200606232910352.jpg" />
让苏军意想不到的是，在研究所内，除了一些必要的实验设备，他们还发现了3吨氧化铀、250千克金属铀和20升重水。贝利亚和马林科夫在行动报告中提醒斯大林：“威廉物理研究所在盟军占领区，而这些设备和材料非常重要，我们必须将这些设备和材料运回苏联。”苏联国防委员会批准将威廉物理研究所的所有设备、文件和材料运回苏联，由苏联秘密警察特别金属部门和科学院的二号实验室参与接收。
马赫涅夫虽然围捕了实验室的蒂森教授和贝韦洛格博士。但是他们还是漏了一些更重要的人物，包括海森贝格、劳厄和诺贝尔化学奖得主哈恩等。因为英国人早已惦记上这些人，并将他们带往了英国。除此之外，其他一些不重要的实验室和研究所也被拆除，更多的德国科学家被遣送到集中营特别关押所。阿登是他们之中的一名志愿者，他向苏联人民代表委员会写了一封申请信，希望可以同苏联的物理学家们一起工作，听从苏联政府管理。贝利亚和库尔哈托夫终于得到了一些铀和物理专家，研究工作可以马上进行，不过原材料的供应还是较为紧张。希洛夫将军接到命令，必须重点保护捷克斯洛伐克，因为在德累斯顿南部的萨克松尼有铀矿。而美国巴顿将军率领的第3集团军正在攻入这一地区，这让苏军非常头疼。同样，苏军摸不准美军是否会遵守协定，撤回到先前的占领区，这也是苏联感到紧张的原因。