他近年写佛教的文章，也不离这三个法宝，转化成菩提，其三种面目是：①生活中就有禅机，无处不是开悟的时刻。②每天使自己超越一些、广大一些、圆满一些、提升一些，往菩萨的道路迈进。③佛教是最感性、最浪漫、最有想象力、最完美主义、最终极理想的宗教，因此，要使佛教落实于人生，使人生美丽动人一如菩萨世界。
林清玄以菩萨的感性风格与浪漫情怀写成的“菩提系列”感动了无数读者，令他成为最畅销的作家之一，但是他说：“这表示我们这个社会很需要清净、提升与超越。”
出版了四十几本作品的林清玄表示，他到写《星月菩提》《如意菩提》《拈花菩提》以及即将出版的《清凉菩提》时，才感觉自己会写文章。
他说：“以前我得过吴三连文艺奖、台湾文艺奖、中山文艺奖、金鼎奖，以及时报、中华的散文首奖，那时我很注意作品的技巧，例如文字、结构、主题等等，可是不觉得自己会写文章。一直到写最近这几本书，才觉得自己挣脱了技巧的束缚，能以一种自然、诚挚、单纯的心来写文章，我觉得这是智慧开启的结果。”由于技巧的超越，使他的文章突破了读者的层面，使他的书深入社会各阶层，从小学生到大学教授，从知识分子到老先生老太太，都能接受他的书。这使林清玄觉悟到，只要有思想，以智慧与慈悲作后盾，文学的方法或技巧，都是犹其余事。
林清玄也相信，他近年重新整理佛教与禅宗典籍所写的《菩萨宝偈》与《禅心大地》，将使他的文学迈入一个更崭新的境界。
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当写完了每天的文章，通常已是黄昏，林清玄会带太太孩子到附近去走走，有时到大溪的街上和公园去玩，有时到三峡或树林的寺院去散步，这时他会带一本唐诗，背下几首，使自己能保有轻松的诗的心情。
“文学创作与佛教经典之间并无冲突，它们都是在把人从感官、欲望、物质的世界解脱出来，只是佛教订的标准比文学更高，所以我一直认为喜爱文学的人，比较容易接受佛教，特别是大乘或禅学，这是我从事佛教文学创作最重要的信念。”
他说乡间夜晚没有什么活动，林清玄把整个晚上都用来读经、念佛与打坐，但那也不一定是“功课”，而是他轻松的冥想，他认为，一个人如果把佛的修行当成是“功课”就很容易僵化，若能维持平和的心境，就是最好的功课，他说：“功课应该在二十四小时之中，是在生活、言语、思想的每一个环节展现出来，每日使自己的身口意维持在一个明净单纯的境况，就是我的功课。虽然那是很艰难的，不过，通向菩萨的道路本来就艰难，要有比别人更深刻的承担、更广大的怀抱才行。”
对林清玄而言，散步是功课，写作是功课，听好的音乐是功课，喝一杯好茶是功课，听乡人说说生活的苦恼是功课，对别人微笑是功课，忍辱柔和是功课，看云看星是功课，承受生命的忧恼是功课，生活的点滴无不是心灵改革创造的功课。
在他的内心里，并不期待人人都成为佛教徒或修行者，只希望人人都能有一些宗教的情操，能净化自己浊劣的心灵，并使别人得到净化。
他常常对自己说：“我要时时刻刻要求自己，但我不要随时要求众生。”
原因在于，他认为会投生到这个世界的人，根本就有很多缺点，因此，不要去要求众生如何如何，因为众生若可以像我们要求的那样完美，也就不会沦落到这个世界来受诸苦恼了。
“你又有什么资格来教化别人呢？你是不是已经开悟了？你自己没有缺点吗？”常常有人这样问林清玄。
他说：“我当然不算开悟，但我希望每天都有一些对人生的新观点；我也有很多缺点，因此我每天都在反省、惭愧，还有忏悔，我也没有资格教化别人，我的作品只是在探索人的心灵世界，而不是在给别人开示。我希望别人读了我的作品有这样的感觉：好像在热恼的天气被和风吹拂，好像在黑夜中把灯开亮，好像在渴的时候喝到凉水，好像埋首案前突然抬头看见青山，那和风、灯光、凉水、青山都在人自己的四周，人在其中得到的安顿并不是我所赋予的。”
林清玄认为，如果别人读他的作品得到利益与开启，那都是佛菩萨的功德，以及人的自性有本具的光明，他的文章只是一个工具而已。
他愿像芒花，没有心机，也期许自己像和风，轻轻的吹拂大地，至于被吹拂的人有什么感受，“我是无能为力的。”
就如同他花了十几年，把自己最宝贵的青春奉献给新闻事业，那只是青年淑世的热情与改革的怀抱，至于社会是否因他的投入而改造，他并不介怀。如今专事写作，也只能尽一己之力，无怨的迈进，在写作近二十年的时间里，他的座右铭是：“沧浪之水清，可以涤我缨；沧浪之水浊，可以涤我足。”他现在期许自己做沧浪之水，至于别人拿来洗帽或洗脚，那实在是超出他能力的范围。
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当他听到当选为一九八八年出版界年度风云人物时，感到非常意外，并且诚惶诚恐，因为他觉得自己应该更谦下一些，实在配不上“风云”这两个字。不过，他愿意做“和风”与“柔云”，不要让人觉得有什么不同，一如人们不在乎风或云的存在。
新年开始，林清玄即将出版的书有《清凉菩提》、《菩萨宝偈》、《禅心大地》、《心的丝路》四本书，他希望读者继续爱惜他，希望大家把他当成平凡的人，而不是一个畅销作家，也希望对他的书畅销感到疑惑的人，都能原谅他，因为，他实在没有能力使一本书畅销，书既然畅销了，也是“罪不在我”，或是“成功不在我”。
“有一位师父告诉我，应该学习把所有的人都看成是纯洁的人，应该学习看见人时都见到他们的缺失，表示自己还有很多缺失。我希望能不断地做这种学习，当我每次这样想时，我就觉得自己还需要很多锤炼，而生命的学习，还有很长的路要走。”林清玄如是说。
林清玄就是这样平凡的人，当人们与他擦肩而过，不会认出他有什么特殊，甚至在他居住乡间的这段时间，从来没有人觉得他有什么卓然不群的地方。他去瓷砖工厂看人做瓷砖，别人以为他是工人；他去买水果站在水果摊旁，有人问他：“老板，释迦一斤多少钱？”他去市场买青菜，卖菜的人看他穿雨鞋，一把菜便宜他两元；他带孩子到山上放风筝，一个工厂的老板问他：“最近是不是失业，要不要到我的工厂做大夜班？”他去河边捡石头，钓鱼的人用台语说他：“憨猴捡石头。”他去庙里散步，一个老太太好心的劝他说：“少年家，不要一天到晚晃荡，要多念阿弥陀佛呀！”……
他觉得那样的生命才是安然，是真实的活在众生之中，因此在他的书桌上压了两句话：
欲为诸佛龙象 先做众生马牛
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